提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
节令之美·立春｜4日10时42分立春，“打春”啦！******
“一二三四五六七，万木生芽是今日。”北京时间2月4日10时42分将迎来二十四节气中的立春。此时节，大地逐渐苏醒，万物开始复苏，“间泮游鱼跃，和风待柳芳”。
关于立春，民谚有“春打五九尾(尽)，春打六九头”之说。其意是，立春这一天要么在五九的最后一天，要么在六九的第一天。
今年的立春属于哪一种情况？“我国民间有从冬至这一天开始‘数九’的习俗。2022年12月22日冬至，数一数会发现，2023年2月4日是五九的最后一天，很明显2023年立春是‘春打五九尾’。冬至通常出现在公历每年的12月21日或22日。如果2022年的冬至出现在12月21日，那么，2023年立春就是‘春打六九头’。”中国天文学会会员、天津市天文学会理事杨婧说。
立春在公历年中的日期基本固定，绝大多数年份为2月4日，个别年份为2月3日或2月5日。因此从公历来说，不论是平年还是闰年，每年都会出现一次立春，而农历闰年，一年中则会出现25个节气，年初和年尾各有一个立春，民间称这种情况为“一年两头春”“双春年”或“两春夹一冬”。
刚刚到来不久的癸卯年就属于这种情况，癸卯年的正月十四立春(2023年2月4日)和同年的腊月二十五立春(2024年2月4日)。巧合的是，癸卯年的第二个立春也落在五九的最后一天，因此，2024年的立春也是“春打五九尾”。
杨婧表示，“春打五九尾”和“春打六九头”是经常而又不规则地交替着，但无论是“五九尾”还是“六九头”，立春的到来，都是农民朋友准备新一年耕种的时候。提前做好各项农事安排，有利于农作物更好生长。
立春，是时序轮转、日夜更迭的漫漫光阴里具有仪式感的一天。对我国古人而言，春耕如晨钟，秋收似暮鼓，立春之日寓意盛大。
立春之日，自古以来，我国民间就有“鞭春”“打春”的习俗，也就是鞭打春牛，也称鞭打土牛，寓意来年五谷丰登、国泰民安，提醒人们春耕即将开始，莫误农时。
统筹：刘心惠、刘元旭
记者：周润健
海报制作：方金洋
编辑：李民
新华社国内部、天津分社联合制作
节令工作室出品
| 网信购彩地图 |
